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2025-08-1896 次浏览
论文 | 不用扩增也能测microRNA?耐思胎牛血清养出的细胞给出高分答案

文章名称:Regulating cleavage activity and enabling microRNA detection with split sgRNA in Cas12b

中文名称:基于Cas12b的分裂型sgRNA,实现其切割活性调控,并支持microRNA检测

杂志名:Nature Communications

期刊影响因子:15.7

第一作者:Jiaqi Wang

通讯作者:Zhaoxing Liu

发表日期:2025.07.10

doi:10.1038/s41467-025-61748-4


研究内容

内容概述:本研究提出了一种将Cas12bsgRNA 拆分为两个片段(即“分裂 sgRNA”)的策略。该策略利用通用骨架结构与可定制的 Spacer 区域相结合,实现了对 Cas12b 切割活性的精确调控。同时,此方法支持无需核酸扩增的 microRNA 直接检测。研究结果表明,通过优化 sgRNA 结构可有效降低脱靶效应并抑制背景切割信号,从而构建了一个具有高灵敏度和高特异性的 microRNA 检测平台。


研究背景

基因编辑和核酸检测领域,Cas12b是一种极具潜力的 CRISPR-Cas 系统。然而,传统 sgRNA 设计易引发背景切割和脱靶效应,需更精细的活性调控策略。同时,作为重要生物标志物的 microRNA,其检测面临浓度低、结构复杂等挑战。为此,本研究旨在开发一种新型 sgRNA 架构,在实现对 Cas12b 活性精准调控的同时,支持无需扩增的 microRNA 直接检测。


实验方法与过程

  • sgRNA 分裂设计:将 sgRNA 拆分为 scaffold 部分与 Spacer 部分分别表达或组装。

  • 活性调控评估:通过体外Cas12b 切割实验验证不同组合,测定切割效率与背景活性。

  • microRNA 检测方案建立:结合报告片段和荧光信号输出,无需逆转录扩增即可检测目标 microRNA

  • 灵敏度与特异性测试:在多种microRNA 浓度梯度中测试检测下限与选择性。


Cas12b的sgRNA和分裂sgRNA的方案概述

 

实验结果

  • 活性调控:成功拆分sgRNA 显著降低 Cas12b 的非特异背景切割,仅在配对正确 Spacer 后激活强信号。

  • 高灵敏检测:检测下限达到picomolar 级别,背景噪音较低。

  • microRNA 特异性良好:能区分近似序列差异较小的 microRNA,通过 Spacer 定制即可切换检测目标。



结论

split sgRNA 的设计具备普适性,只需更换 Spacer 即可扩展至不同 microRNA 或 DNA 靶标,无扩增的检测方法可以简化流程、降低成本与污染风险。平台具备潜力推广至临床快速诊断设备或现场检测(POCT)应用。未来可与纳米载体、光学传感设备等结合,提升整体检测便利性与应用范围。

使用改良的CRISPR-Cas12b 系统检测 miR-172131 和 92a 的表达量

使用同样的检测方法检测健康人(H.D.15)、结直肠癌患者术前(P.D.15 preO) 和 术后(P.D.15 postO) 血浆总 RNA 中的 miR-172131 和 92a 水平


Cas12b split sgRNA 方法 与传统 RT-qPCR 方法对比









论文中用到的NEST产品


胎牛血清

实验:细胞培养

涉及细胞类型:HCT116,SW480NCM460

在本实验中,研究人员使用含FBS的培养基分别培养了结直肠癌细胞系 HCT116、SW480 及正常肠上皮细胞系 NCM460,并从中提取 microRNA。随后,他们利用开发的 split sgRNA-Cas12b 方法检测了 miR-17、miR-21、miR-31 和 miR-92a,并与传统 RT-qPCR 结果进行对比。结果显示,癌细胞中 microRNA 表达量显著高于正常细胞,两种方法结果高度一致。此外,还检测了结直肠癌患者术前术后及健康人群血浆中的 microRNA 水平,验证了其在肿瘤诊断和术后监测中的应用潜力。


NEST胎牛血清的优势



NEST胎牛血清是从牛胎中抽取的血液凝固后剩余的液体部分,通过离心去除细胞、凝固纤维蛋白原和蛋白以得到血清,含有许多有助于细胞生长的成分,包括:如生长因子、附着因子、激素、转运蛋白、脂质、糖类、维生素等。


胎牛血清制作流程图


NEST® 胎牛血清(FBS)国际高标准 × 国产优价格,一瓶解决细胞“营养焦虑”
NEST所有批次的胎牛血清均经过严格的无菌、支原体和病毒检测。每一批次的血清也会在以下细胞系上进行细胞生长、平板效率和克隆效率测试:HeLa、L929、SP2/O-AG14、MRC-5经过认证和特别认证的血清还需要进行一系列额外的测试,包括内毒素、化学成分、蛋白电泳和放射免疫扩散检测等。
▶来源可靠:采自健康胎牛心脏无菌穿刺血,低抗体、低补体,从源头降低免疫干扰。
▶成分丰富: 富含生长因子(EGF、FGF、IGF 等)、附着蛋白(Fibronectin、Vitronectin)及激素、微量元素,满足贴壁、悬浮、干细胞、原代细胞等多场景需求。
▶质量严控:0.1 µm 三级过滤 + 10 项放行检测:无菌、支原体、病毒、总蛋白质量:40±5g/L、内毒素<5 EU/mL、血红蛋白<30 mg/100 mL,批间差异≤10 %。
▶性能验证:HeLa、L929、SP2/0-AG14、MRC-5 多重细胞生长/克隆/铺板实验确认促增殖效率≥80 %,结果稳定可重复。
▶合规追溯:ISO9001 / ISO13485 / GMP 体系生产,每瓶唯一批号,完整溯源链支持 SCI 论文及 IND 申报。

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