文章名称:Regulating cleavage activity and enabling microRNA detection with split sgRNA in Cas12b
中文名称:基于Cas12b的分裂型sgRNA,实现其切割活性调控,并支持microRNA检测
杂志名:Nature Communications
期刊影响因子:15.7
第一作者:Jiaqi Wang
通讯作者:Zhaoxing Liu
发表日期:2025.07.10
doi:10.1038/s41467-025-61748-4
研究内容
内容概述:本研究提出了一种将Cas12bsgRNA 拆分为两个片段(即“分裂 sgRNA”)的策略。该策略利用通用骨架结构与可定制的 Spacer 区域相结合,实现了对 Cas12b 切割活性的精确调控。同时,此方法支持无需核酸扩增的 microRNA 直接检测。研究结果表明,通过优化 sgRNA 结构可有效降低脱靶效应并抑制背景切割信号,从而构建了一个具有高灵敏度和高特异性的 microRNA 检测平台。
研究背景
在基因编辑和核酸检测领域,Cas12b是一种极具潜力的 CRISPR-Cas 系统。然而,传统 sgRNA 设计易引发背景切割和脱靶效应,需更精细的活性调控策略。同时,作为重要生物标志物的 microRNA,其检测面临浓度低、结构复杂等挑战。为此,本研究旨在开发一种新型 sgRNA 架构,在实现对 Cas12b 活性精准调控的同时,支持无需扩增的 microRNA 直接检测。
实验方法与过程
sgRNA 分裂设计:将 sgRNA 拆分为 scaffold 部分与 Spacer 部分分别表达或组装。
活性调控评估:通过体外Cas12b 切割实验验证不同组合,测定切割效率与背景活性。
microRNA 检测方案建立:结合报告片段和荧光信号输出,无需逆转录扩增即可检测目标 microRNA。
灵敏度与特异性测试:在多种microRNA 浓度梯度中测试检测下限与选择性。
Cas12b的sgRNA和分裂sgRNA的方案概述
实验结果
活性调控:成功拆分sgRNA 显著降低 Cas12b 的非特异背景切割,仅在配对正确 Spacer 后激活强信号。
高灵敏检测:检测下限达到picomolar 级别,背景噪音较低。
microRNA 特异性良好:能区分近似序列差异较小的 microRNA,通过 Spacer 定制即可切换检测目标。
结论
split sgRNA 的设计具备普适性,只需更换 Spacer 即可扩展至不同 microRNA 或 DNA 靶标,且无扩增的检测方法可以简化流程、降低成本与污染风险。该平台具备潜力推广至临床快速诊断设备或现场检测(POCT)应用。未来可与纳米载体、光学传感设备等结合,提升整体检测便利性与应用范围。
使用改良的CRISPR-Cas12b 系统检测 miR-17、21、31 和 92a 的表达量
使用同样的检测方法检测健康人(H.D.1–5)、结直肠癌患者术前(P.D.1–5 preO) 和 术后(P.D.1–5 postO) 血浆总 RNA 中的 miR-17、21、31 和 92a 水平
Cas12b split sgRNA 方法 与传统 RT-qPCR 方法对比
论文中用到的NEST产品
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